46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1717 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1717  hypothetical protein  100 
 
 
629 aa  1257    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3820  hypothetical protein  34.23 
 
 
644 aa  274  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.095196  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0204  hypothetical protein  35.45 
 
 
632 aa  273  6e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1890  hypothetical protein  34.33 
 
 
644 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1736  von Willebrand factor type A  31.78 
 
 
604 aa  253  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0250  hypothetical protein  31.53 
 
 
634 aa  248  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.615952  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2703  hypothetical protein  28.69 
 
 
609 aa  176  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0299  von Willebrand factor type A  26.05 
 
 
614 aa  143  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0044  von Willebrand factor type A  25.75 
 
 
606 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1973  hypothetical protein  26.92 
 
 
614 aa  140  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0691  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 
579 aa  124  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0235  hypothetical protein  27.85 
 
 
561 aa  123  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0824  hypothetical protein  27.06 
 
 
656 aa  104  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3261  von Willebrand factor type A  23.29 
 
 
713 aa  104  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00897171 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0770  hypothetical protein  22.8 
 
 
579 aa  64.3  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1165  hypothetical protein  24.36 
 
 
575 aa  57.4  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.684145 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  26.47 
 
 
595 aa  55.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1934  hypothetical protein  22.78 
 
 
627 aa  55.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0768843  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  27.07 
 
 
315 aa  55.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2123  hypothetical protein  28.04 
 
 
483 aa  54.7  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  26.26 
 
 
317 aa  53.9  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  22.12 
 
 
328 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 
319 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  27.87 
 
 
319 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  25.33 
 
 
319 aa  51.2  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  26.82 
 
 
754 aa  50.8  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  28.87 
 
 
651 aa  50.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  28.35 
 
 
313 aa  50.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2647  hypothetical protein  24.4 
 
 
667 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.155328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  30 
 
 
344 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  22.64 
 
 
316 aa  48.1  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  28.46 
 
 
344 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  48.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  27.87 
 
 
335 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  23.32 
 
 
335 aa  47.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  27.05 
 
 
335 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  27.05 
 
 
335 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  27.05 
 
 
335 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  32 
 
 
325 aa  46.2  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  34.44 
 
 
337 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  24.79 
 
 
315 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  25 
 
 
315 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  23.68 
 
 
316 aa  44.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  23.24 
 
 
316 aa  44.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  26.23 
 
 
335 aa  44.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
647 aa  44.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>