15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3261 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3261  von Willebrand factor type A  100 
 
 
713 aa  1402    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00897171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0204  hypothetical protein  28.45 
 
 
632 aa  162  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3820  hypothetical protein  26.08 
 
 
644 aa  127  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.095196  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1717  hypothetical protein  24.87 
 
 
629 aa  114  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1890  hypothetical protein  26.26 
 
 
644 aa  105  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0250  hypothetical protein  24.41 
 
 
634 aa  100  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.615952  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0824  hypothetical protein  22.89 
 
 
656 aa  88.2  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1736  von Willebrand factor type A  24.35 
 
 
604 aa  80.9  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2703  hypothetical protein  24.86 
 
 
609 aa  67.8  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0044  von Willebrand factor type A  19.78 
 
 
606 aa  64.7  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0235  hypothetical protein  20.53 
 
 
561 aa  50.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1973  hypothetical protein  22.53 
 
 
614 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1369  hypothetical protein  28.19 
 
 
597 aa  48.5  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.440453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0691  von Willebrand factor type A  21.95 
 
 
579 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0299  von Willebrand factor type A  20.95 
 
 
614 aa  44.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>