21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3648 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3648  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 334 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0366403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3789  PEGA domain protein  86.98 
 
 		 338 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518163  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3706  PEGA domain protein  86.98 
 
 		 338 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3774  PEGA domain-containing protein  53.47 
 
 		 317 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0363  hypothetical protein  30.91 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3560  PEGA domain protein  27.53 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00097994  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3826  hypothetical protein  31.37 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0247874  normal  0.0380189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1818  PEGA domain protein  28.27 
 
 		 592 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2654  thioredoxin-related protein  35 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.540425 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4011  PEGA domain protein  33.16 
 
 		 438 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0496099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  43.4 
 
 		 409 aa  50.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2825  hypothetical protein  29.41 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  26.74 
 
 		 963 aa  46.2  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  32.08 
 
 		 546 aa  46.2  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  35.85 
 
 		 613 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  42.59 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  30.51 
 
 		 600 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  44.68 
 
 		 684 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 732 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0134  hypothetical protein  29.32 
 
 		 412 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  45.1 
 
 		 456 aa  42.7  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>