More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0888 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0888  translocation protein TolB  100 
 
 		 426 aa  873    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  25.68 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.98 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  29.63 
 
 		 457 aa  130  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  30.1 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  28.36 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  26.78 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  29.5 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  28.23 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  27.96 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  26.03 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  28.7 
 
 		 436 aa  117  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  27.99 
 
 		 444 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  29.74 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  25.71 
 
 		 435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  30.52 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  30.19 
 
 		 430 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.72 
 
 		 444 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.14 
 
 		 407 aa  112  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  29.47 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  28.3 
 
 		 440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  25.29 
 
 		 424 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  28.36 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  26.67 
 
 		 427 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  26.5 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  29.47 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  26.5 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  27.27 
 
 		 442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  27.04 
 
 		 437 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.11 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  30.03 
 
 		 426 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  25.57 
 
 		 461 aa  110  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  31.34 
 
 		 450 aa  109  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  26.5 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  28.76 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  27.76 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  27.51 
 
 		 441 aa  108  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  27.92 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  28.43 
 
 		 440 aa  107  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  27.8 
 
 		 443 aa  106  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  27.63 
 
 		 446 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  25.32 
 
 		 432 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  27.36 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  25.88 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.71 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  25.76 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  27.8 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  26.77 
 
 		 449 aa  104  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  29.32 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  27.16 
 
 		 443 aa  104  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  26.5 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  28.81 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  26.5 
 
 		 440 aa  103  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  26.38 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  26.44 
 
 		 435 aa  103  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  27.78 
 
 		 438 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  28.3 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  28.3 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  28.3 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  28.3 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  28.3 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  26.43 
 
 		 450 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  28.81 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  28.3 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  26.35 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  28.3 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.75 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  24.18 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  24.69 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  29.93 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  25 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  24.56 
 
 		 441 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  25.24 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  26.06 
 
 		 445 aa  99.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  25.87 
 
 		 445 aa  99.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  26.48 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  27.84 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  23.79 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  27.99 
 
 		 463 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  25.73 
 
 		 421 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  26.48 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  26.48 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  26.48 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  26.48 
 
 		 431 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.69 
 
 		 430 aa  98.2  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  27.15 
 
 		 441 aa  97.4  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  27.3 
 
 		 434 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  26.17 
 
 		 431 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  27.92 
 
 		 420 aa  97.1  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  23.08 
 
 		 439 aa  97.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  26.24 
 
 		 442 aa  96.7  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  26.17 
 
 		 431 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  25.17 
 
 		 451 aa  96.3  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  31.55 
 
 		 572 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  27.15 
 
 		 442 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  23.49 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  27.15 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  26.97 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  27.15 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  26.49 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>