46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1379 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1379  glycosyl hydrolase-like protein  100 
 
 
330 aa  634    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  22.34 
 
 
374 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  27.46 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  27.21 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  23.43 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  25 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 
1154 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  24.09 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  20.97 
 
 
1115 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.23 
 
 
433 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 
1101 aa  63.5  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  20.59 
 
 
1115 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  21.54 
 
 
542 aa  62.8  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  20.65 
 
 
1115 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  32.9 
 
 
484 aa  62.4  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  20.59 
 
 
1115 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  26.44 
 
 
427 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 
1124 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  20.26 
 
 
1119 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  27.55 
 
 
647 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  27.22 
 
 
1118 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  31.47 
 
 
430 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  20.37 
 
 
927 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  22.05 
 
 
349 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  19.93 
 
 
316 aa  53.1  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  23.18 
 
 
426 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  23.23 
 
 
579 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  23.79 
 
 
503 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  25 
 
 
420 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  25.81 
 
 
688 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  24.59 
 
 
1120 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 
793 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  23.86 
 
 
426 aa  46.2  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  26.71 
 
 
390 aa  46.2  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 
583 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  22.94 
 
 
451 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  20 
 
 
418 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  21.47 
 
 
430 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  21.47 
 
 
430 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  21.47 
 
 
430 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  21.47 
 
 
430 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  21.47 
 
 
430 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  21.47 
 
 
342 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>