69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5996 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5996  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 		 270 aa  538  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5763  Peptidoglycan-binding LysM  43.02 
 
 		 209 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.375641 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  29.92 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  25.45 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  31.36 
 
 		 849 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  36.17 
 
 		 289 aa  52.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  31.15 
 
 		 563 aa  52.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  29.45 
 
 		 733 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.65 
 
 		 797 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  29.6 
 
 		 389 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  31.25 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  27.92 
 
 		 560 aa  49.3  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  34.69 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  29.91 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  26.32 
 
 		 415 aa  48.9  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  24.51 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.5 
 
 		 637 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.85 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.67 
 
 		 593 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  30.56 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  30.56 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  27.88 
 
 		 179 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.46 
 
 		 579 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.67 
 
 		 631 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  31 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.93 
 
 		 1001 aa  47  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.34 
 
 		 576 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  28.72 
 
 		 465 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  28.7 
 
 		 620 aa  46.2  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  28.75 
 
 		 338 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  28.97 
 
 		 301 aa  45.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  28.83 
 
 		 557 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  26.21 
 
 		 503 aa  45.8  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  29.09 
 
 		 544 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  29.41 
 
 		 546 aa  45.4  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  29.79 
 
 		 423 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  26.92 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  29.73 
 
 		 542 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  36 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 444 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  34.67 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  34.67 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  33.33 
 
 		 466 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  34.67 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  28.57 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  30.1 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  34.67 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  30.3 
 
 		 1021 aa  43.5  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0474  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.92 
 
 		 801 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  34.67 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.18 
 
 		 470 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  36 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  34.67 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.7 
 
 		 475 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  28.57 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  30.61 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  29.29 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  26.64 
 
 		 548 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  29.29 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  32.65 
 
 		 571 aa  43.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  49.06 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  28.87 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  33.71 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.67 
 
 		 597 aa  42.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000317907  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  28.42 
 
 		 503 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1699  Peptidoglycan-binding LysM  43.48 
 
 		 183 aa  42  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.578392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  30.53 
 
 		 363 aa  42.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  34.38 
 
 		 430 aa  42  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.45 
 
 		 840 aa  42  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>