20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4581 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4581  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  146  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484909  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  76.67 
 
 
194 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  76.67 
 
 
207 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  76.67 
 
 
203 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  76.67 
 
 
203 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  76.67 
 
 
194 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  76.67 
 
 
194 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  76.67 
 
 
194 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  76.67 
 
 
194 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  76.67 
 
 
194 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  76.67 
 
 
194 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  76.67 
 
 
194 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  73.33 
 
 
200 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  73.33 
 
 
194 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  73.33 
 
 
193 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  73.33 
 
 
194 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  73.33 
 
 
192 aa  48.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  70 
 
 
194 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  66.67 
 
 
275 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  63.33 
 
 
261 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>