More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5288 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  100 
 
 
257 aa  511  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  100 
 
 
257 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  100 
 
 
257 aa  511  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  92.61 
 
 
256 aa  471  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  87.94 
 
 
256 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  87.94 
 
 
256 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  91.05 
 
 
256 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  81.71 
 
 
256 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  81.71 
 
 
256 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  87.28 
 
 
248 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  92.38 
 
 
248 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  81.91 
 
 
225 aa  325  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  91.46 
 
 
164 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  66.35 
 
 
241 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  66.35 
 
 
241 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  63.89 
 
 
221 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  65.7 
 
 
230 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  64.39 
 
 
239 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  60.93 
 
 
469 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  64.73 
 
 
228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  62.75 
 
 
469 aa  258  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  62.75 
 
 
469 aa  258  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  62.75 
 
 
469 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  63.41 
 
 
469 aa  258  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  62.75 
 
 
467 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  61.35 
 
 
467 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  61.35 
 
 
467 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  60.94 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  61.62 
 
 
475 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  61.62 
 
 
475 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  61.62 
 
 
475 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  57.41 
 
 
472 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  57.49 
 
 
472 aa  247  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  58.59 
 
 
478 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  56.28 
 
 
479 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  55.98 
 
 
432 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  61.65 
 
 
427 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  49.3 
 
 
505 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  52.74 
 
 
249 aa  152  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  47.13 
 
 
498 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3253  NLP/P60 protein  40.64 
 
 
214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2702  NLP/P60 protein  42.77 
 
 
204 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2672  NLP/P60  42.2 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0993565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2717  NLP/P60 protein  42.2 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0128692  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2970  NLP/P60 protein  37.8 
 
 
208 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  38.3 
 
 
388 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
388 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.52 
 
 
388 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.26 
 
 
329 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  41.8 
 
 
204 aa  89.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  48.39 
 
 
411 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  39.84 
 
 
452 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  41.8 
 
 
491 aa  87  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  41.74 
 
 
308 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  45.95 
 
 
302 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  40.34 
 
 
447 aa  87  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  42.75 
 
 
495 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  38.52 
 
 
502 aa  85.5  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  43.4 
 
 
180 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.74 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  35.96 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  34.32 
 
 
625 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.34 
 
 
531 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  43.64 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  43.1 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5534  NLP/P60 protein  39.57 
 
 
420 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  34.44 
 
 
1048 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  43.24 
 
 
257 aa  82  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
374 aa  82  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  44.14 
 
 
199 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  44.66 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  43.24 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  39.47 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  38.64 
 
 
393 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  35.48 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.6 
 
 
475 aa  79.7  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  40.95 
 
 
487 aa  79.3  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  39.64 
 
 
394 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  41.96 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  36.94 
 
 
340 aa  78.6  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.9 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  37.59 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  44.55 
 
 
535 aa  77.4  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  36.07 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  31.55 
 
 
333 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  36.89 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  38.14 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  38.76 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  38.74 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  40 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  34.71 
 
 
476 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  42.34 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  36.69 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  33.33 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  42.98 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  33.61 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.589306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>