More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2872 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  100 
 
 		 164 aa  327  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  91.46 
 
 		 257 aa  307  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  91.46 
 
 		 257 aa  307  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  91.46 
 
 		 257 aa  307  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  93.29 
 
 		 256 aa  307  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  92.07 
 
 		 256 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  92.07 
 
 		 256 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  91.46 
 
 		 256 aa  304  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  90.85 
 
 		 248 aa  302  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  87.8 
 
 		 248 aa  295  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  85.37 
 
 		 256 aa  294  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  85.37 
 
 		 256 aa  294  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  76.22 
 
 		 225 aa  253  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  62.94 
 
 		 239 aa  213  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  62.05 
 
 		 469 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  64.63 
 
 		 221 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  64.63 
 
 		 241 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  64.63 
 
 		 241 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  61.45 
 
 		 469 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  61.45 
 
 		 469 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  60.84 
 
 		 469 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  60.84 
 
 		 469 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  62.65 
 
 		 467 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  60.24 
 
 		 467 aa  208  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  61.49 
 
 		 475 aa  208  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  60.24 
 
 		 467 aa  208  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  61.49 
 
 		 475 aa  208  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  61.49 
 
 		 475 aa  208  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  60.24 
 
 		 472 aa  207  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  60.36 
 
 		 472 aa  206  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  61.59 
 
 		 230 aa  204  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  69.85 
 
 		 253 aa  203  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  57.06 
 
 		 478 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  56.44 
 
 		 479 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  59.76 
 
 		 228 aa  193  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  54.44 
 
 		 432 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  57.14 
 
 		 427 aa  151  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  49.3 
 
 		 505 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  52.94 
 
 		 249 aa  144  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 498 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3253  NLP/P60 protein  40.64 
 
 		 214 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2702  NLP/P60 protein  43.35 
 
 		 204 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2672  NLP/P60  42.77 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0993565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2717  NLP/P60 protein  42.77 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0128692  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2970  NLP/P60 protein  37.32 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.95 
 
 		 388 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 388 aa  96.7  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.28 
 
 		 388 aa  96.3  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.68 
 
 		 329 aa  88.2  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5534  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 420 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  50.43 
 
 		 411 aa  87.4  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 308 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 452 aa  86.3  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  37.68 
 
 		 308 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  42.22 
 
 		 302 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 447 aa  85.5  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 502 aa  85.5  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  39.55 
 
 		 257 aa  84.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 180 aa  84.3  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  42.48 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  35.4 
 
 		 625 aa  83.6  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 491 aa  82.4  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  46.08 
 
 		 487 aa  82.4  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  45.54 
 
 		 495 aa  81.6  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  34.67 
 
 		 1048 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 337 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.18 
 
 		 438 aa  80.9  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  36.31 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  41.28 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 535 aa  77.8  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  37.9 
 
 		 393 aa  77.4  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2622  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.88 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.47 
 
 		 475 aa  77  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  41.23 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.34 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  37.19 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  36.97 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  40 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.82 
 
 		 531 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  37.59 
 
 		 463 aa  75.1  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  42.16 
 
 		 391 aa  75.1  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 340 aa  75.1  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  35.88 
 
 		 476 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.13 
 
 		 372 aa  74.3  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  33.56 
 
 		 333 aa  74.3  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 257 aa  73.9  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  33.81 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  37.86 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  42.59 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  35.34 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.14 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>