More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2970 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2970  NLP/P60 protein  100 
 
 
208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3253  NLP/P60 protein  81.11 
 
 
214 aa  331  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2702  NLP/P60 protein  55.71 
 
 
204 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2672  NLP/P60  54.79 
 
 
204 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0993565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2717  NLP/P60 protein  54.79 
 
 
204 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0128692  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  51.46 
 
 
249 aa  176  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  41.01 
 
 
475 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  41.01 
 
 
475 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  41.01 
 
 
475 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  38.57 
 
 
472 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  40.45 
 
 
467 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  40.45 
 
 
467 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  39.89 
 
 
225 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  39.89 
 
 
472 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  40.68 
 
 
432 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  38.76 
 
 
478 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  38.76 
 
 
479 aa  121  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  41.99 
 
 
253 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  37.8 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  41.24 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  37.8 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  41.24 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  37.8 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  39.89 
 
 
469 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  39.89 
 
 
467 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  37.91 
 
 
469 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  37.8 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  41.24 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  40.11 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  40.11 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  37.32 
 
 
164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  40.11 
 
 
248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  39.33 
 
 
469 aa  117  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  39.33 
 
 
469 aa  117  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  38.98 
 
 
248 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  40.11 
 
 
256 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  38.95 
 
 
239 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  37.29 
 
 
241 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  37.29 
 
 
241 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  37.29 
 
 
221 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  37.29 
 
 
505 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  36.42 
 
 
427 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  35.23 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  34.09 
 
 
230 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  33.15 
 
 
498 aa  85.1  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  41.46 
 
 
150 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  30.95 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  30.12 
 
 
553 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  41.46 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  37.35 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  30.07 
 
 
549 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  31.87 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  40.51 
 
 
391 aa  63.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  31.36 
 
 
317 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  41.25 
 
 
333 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  27.88 
 
 
388 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  34.09 
 
 
388 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
335 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  33.33 
 
 
217 aa  62  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  39.24 
 
 
208 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  34.69 
 
 
295 aa  61.6  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
417 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  41.11 
 
 
350 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3470  NLP/P60 protein  38.81 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0763319  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.97 
 
 
329 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  35.64 
 
 
384 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  38.55 
 
 
491 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  40 
 
 
1048 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  38.75 
 
 
476 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  40 
 
 
337 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  39.47 
 
 
331 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  38.96 
 
 
257 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  36.78 
 
 
388 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  44.71 
 
 
532 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  49.25 
 
 
370 aa  60.1  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  44.78 
 
 
487 aa  60.1  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  37.18 
 
 
458 aa  60.5  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  32.14 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  41.54 
 
 
337 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2633  NLP/P60 protein  38.81 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  34.09 
 
 
452 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  32.14 
 
 
269 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
411 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  35.63 
 
 
393 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
392 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  38.64 
 
 
259 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.5 
 
 
438 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  40 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  40 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  39.76 
 
 
348 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  39.76 
 
 
347 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  43.21 
 
 
625 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.21 
 
 
390 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  40.7 
 
 
190 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.2 
 
 
292 aa  58.5  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
265 aa  58.2  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  39.44 
 
 
231 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  37.21 
 
 
285 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.29 
 
 
372 aa  57.4  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>