More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0303 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0303  NLP/P60 protein  100 
 
 		 357 aa  718    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  32.74 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  51.11 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  37.9 
 
 		 419 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  42.74 
 
 		 217 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  38.24 
 
 		 240 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 476 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  40 
 
 		 378 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  45 
 
 		 372 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  43.75 
 
 		 523 aa  86.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  45 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  45 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 		 327 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.37 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.45 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  36 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  46.88 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  39.42 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 536 aa  79.7  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.36 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  41.12 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  33.97 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  38.24 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  42.57 
 
 		 156 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 183 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  35.94 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  43.62 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.18 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  34.48 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  35 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  40.54 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  40.59 
 
 		 556 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  43.62 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  38.74 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  37.61 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  33.62 
 
 		 162 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  45.26 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  43.88 
 
 		 167 aa  77.4  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  45 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  30.23 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  35.09 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  33.12 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  35.25 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  37.72 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  37.72 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  37.72 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  38.68 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  38.68 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  35.09 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  43.81 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  39.25 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  43.81 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  43.81 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  43.81 
 
 		 170 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  28.97 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  32.2 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  43.81 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  43.81 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  34.17 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  50.59 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  42.06 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  41.03 
 
 		 532 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  43.81 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  35.65 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  26.94 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  39.25 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  36.19 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  43.81 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  43.81 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  35.29 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  37.5 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  39.25 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  40.16 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  24.64 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  41.41 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  30 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  40 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0438  SH3 type 3 domain protein  40.95 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  40.71 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.62 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27980  muramidase (flagellum-specific)  36.36 
 
 		 645 aa  73.2  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  39.8 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  36.5 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  40.59 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>