More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27980 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27980  muramidase (flagellum-specific)  100 
 
 		 645 aa  1276    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0533  peptidoglycan hydrolase  55.7 
 
 		 218 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.679599  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1912  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.97 
 
 		 194 aa  127  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.67 
 
 		 619 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.67 
 
 		 619 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.27 
 
 		 655 aa  124  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.14 
 
 		 574 aa  112  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0159  muramidase  42.38 
 
 		 623 aa  103  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000101844  unclonable  2.74193e-27 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1289  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  38 
 
 		 348 aa  100  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0429221  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  39.1 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  43.82 
 
 		 366 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  42.59 
 
 		 227 aa  83.2  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  37.9 
 
 		 1048 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  41.75 
 
 		 293 aa  82.8  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  43.01 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  42.31 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.79 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  38.14 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  43.56 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  39.17 
 
 		 335 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  36.51 
 
 		 211 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.53 
 
 		 332 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  40.78 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  37.09 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 347 aa  79.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  40.86 
 
 		 491 aa  78.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  38.24 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  32.24 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  35.16 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  35.16 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  39.45 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 177 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  41.28 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  39.67 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 177 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.38 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  34.69 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  35.25 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  35.25 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  35.25 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  35.25 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  35.25 
 
 		 234 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 150 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 189 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  35.25 
 
 		 234 aa  77  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  35.25 
 
 		 234 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 363 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.89 
 
 		 475 aa  76.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 183 aa  77  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  35.16 
 
 		 224 aa  77  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  40.43 
 
 		 150 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  39.8 
 
 		 181 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  39.8 
 
 		 181 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 223 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  36.45 
 
 		 224 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  43 
 
 		 335 aa  76.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  37.38 
 
 		 223 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  33.6 
 
 		 192 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 223 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  43.01 
 
 		 345 aa  76.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  36.22 
 
 		 173 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  38.78 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 194 aa  75.5  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  41.32 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  39.09 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  40.31 
 
 		 568 aa  75.5  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 202 aa  75.5  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.9 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  37.62 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  32.48 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  41.49 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  40.82 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  38.3 
 
 		 156 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  40 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  36.45 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  32.26 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  39.09 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  36.63 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  36.13 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  34.39 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  32.52 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  33.06 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  39.05 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  36.79 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  34.43 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  38.04 
 
 		 159 aa  73.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  40.57 
 
 		 333 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  35.64 
 
 		 273 aa  73.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  38.83 
 
 		 205 aa  73.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  41.49 
 
 		 361 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  41.49 
 
 		 361 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>