25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0656 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0656  chromosome segregation ATPases-like protein  100 
 
 
526 aa  1023    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611009  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  50 
 
 
523 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  34.87 
 
 
434 aa  76.6  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0100  hypothetical protein  36.63 
 
 
483 aa  70.5  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  27.32 
 
 
389 aa  60.1  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  22.05 
 
 
379 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  33.33 
 
 
227 aa  53.9  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  30.2 
 
 
372 aa  53.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  31.03 
 
 
360 aa  53.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  26.79 
 
 
374 aa  52.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  23.36 
 
 
376 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  26.13 
 
 
374 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  27.98 
 
 
377 aa  50.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  25.28 
 
 
371 aa  50.4  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  21.76 
 
 
379 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  22 
 
 
412 aa  48.5  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1075  hypothetical protein  24.44 
 
 
413 aa  48.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.855575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  37.04 
 
 
925 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  24.27 
 
 
371 aa  47.4  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  22.99 
 
 
373 aa  47.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07340  hypothetical protein  29.95 
 
 
390 aa  46.6  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.471719  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13270  hypothetical protein  24.71 
 
 
389 aa  46.6  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265233  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0816  hypothetical protein  52.56 
 
 
373 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00128516  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  36.25 
 
 
324 aa  45.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  23.53 
 
 
375 aa  43.9  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>