19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8106 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8106  SLT domain protein-like protein  100 
 
 		 416 aa  843    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  93.94 
 
 		 393 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30070  transglycosylase family protein  45.71 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.398467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38120  transglycosylase family protein  44.68 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4936  Lytic transglycosylase catalytic  42.31 
 
 		 278 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  45.13 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0731  Lytic transglycosylase catalytic  40.98 
 
 		 289 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860163  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  48.44 
 
 		 1216 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5589  hypothetical protein  37.5 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13931  hypothetical protein  42.7 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0880778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  40.28 
 
 		 1510 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  40.28 
 
 		 1510 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0848  peptidase M23B  34.11 
 
 		 743 aa  53.5  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1637  SLT domain-containing protein  39.47 
 
 		 1736 aa  53.1  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  42.7 
 
 		 767 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  37.33 
 
 		 2066 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  37.33 
 
 		 2066 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  46.15 
 
 		 1566 aa  46.6  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1107  phage tape measure protein  36.84 
 
 		 1276 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>