More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1243 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1243  NLP/P60 protein  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215255  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.46 
 
 		 176 aa  100  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 367 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.71 
 
 		 332 aa  94  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  39.35 
 
 		 162 aa  91.3  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  43.55 
 
 		 160 aa  90.5  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 326 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  42.48 
 
 		 392 aa  87.8  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  40.71 
 
 		 368 aa  87.8  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  42.99 
 
 		 286 aa  87.4  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 278 aa  85.5  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  37.72 
 
 		 347 aa  84.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  36.42 
 
 		 501 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  38.33 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  46.08 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  45.35 
 
 		 335 aa  81.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  36.99 
 
 		 517 aa  82  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 366 aa  80.9  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  41.28 
 
 		 453 aa  80.9  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  43 
 
 		 337 aa  80.9  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  35.4 
 
 		 366 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  36.29 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  41.58 
 
 		 306 aa  77.8  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  43.62 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  40.2 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  43.75 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  34.31 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  36.44 
 
 		 374 aa  75.5  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 381 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  36.22 
 
 		 452 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.5 
 
 		 321 aa  73.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  40 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  39.78 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  33.12 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  33.12 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  29.52 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  33.12 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  36.7 
 
 		 446 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  33.12 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15430  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.68 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0612383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  37.39 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  33.12 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  37.39 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  37.39 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  34.96 
 
 		 275 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  35.65 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  37.74 
 
 		 459 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  34.96 
 
 		 271 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  34.96 
 
 		 271 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  34.96 
 
 		 271 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  34.96 
 
 		 271 aa  72  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  40.35 
 
 		 273 aa  72  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  34.96 
 
 		 271 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  34.96 
 
 		 271 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27980  muramidase (flagellum-specific)  45.57 
 
 		 645 aa  71.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  34.96 
 
 		 271 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  34.96 
 
 		 271 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 283 aa  72  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  35.78 
 
 		 350 aa  71.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  45.88 
 
 		 349 aa  71.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.57 
 
 		 210 aa  70.9  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  40.4 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  38.68 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  44 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  39.22 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  38.26 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  35.92 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  36.04 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  35.29 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  33.33 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.22 
 
 		 438 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  32 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  35.4 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  40.26 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  30.97 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 394 aa  68.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  34.78 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  41.24 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1684  NLP/P60 protein  37.39 
 
 		 356 aa  68.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  37.04 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5763  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 362 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  35.25 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  40.86 
 
 		 373 aa  68.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  29.94 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  35.59 
 
 		 432 aa  67.8  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  39.17 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>