More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1884 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1884  NLP/P60 protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.715704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  38.36 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  39.57 
 
 		 148 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  36.55 
 
 		 193 aa  104  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  41.61 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  40.94 
 
 		 150 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4708  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341111  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  36.2 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  36.2 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  36.2 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  35.19 
 
 		 188 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  35.19 
 
 		 188 aa  100  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  35.19 
 
 		 188 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  35.19 
 
 		 188 aa  100  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  35.19 
 
 		 188 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  35.19 
 
 		 188 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  35.19 
 
 		 188 aa  100  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  35.19 
 
 		 188 aa  100  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  35.19 
 
 		 188 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  35.71 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  36.3 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  35.71 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  35.71 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  36.62 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  36.62 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  35.71 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  36.62 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  35.71 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  35.06 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  35.06 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  35.06 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  35.06 
 
 		 154 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  36.48 
 
 		 157 aa  98.6  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  35.06 
 
 		 154 aa  98.2  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  35.21 
 
 		 154 aa  98.2  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  35.21 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  35.21 
 
 		 154 aa  97.8  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  30.95 
 
 		 207 aa  97.4  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  34.64 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  36.2 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  39.55 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  36.77 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  33.57 
 
 		 154 aa  95.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 154 aa  94.4  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  42.06 
 
 		 147 aa  94  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  42.06 
 
 		 147 aa  94  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  34.57 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  44.21 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  46.88 
 
 		 191 aa  91.7  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  45.63 
 
 		 196 aa  92  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  35.29 
 
 		 171 aa  91.3  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  33.77 
 
 		 154 aa  91.3  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  31.85 
 
 		 166 aa  91.3  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  35.54 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  40 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  40 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  45.54 
 
 		 207 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  40 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  35.54 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  30.63 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  45.26 
 
 		 194 aa  88.6  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  45.26 
 
 		 194 aa  88.6  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  33.58 
 
 		 214 aa  88.6  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  33.55 
 
 		 154 aa  88.2  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  33.55 
 
 		 154 aa  88.2  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  34.3 
 
 		 191 aa  87.8  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 189 aa  87.4  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  37.9 
 
 		 191 aa  87.4  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  45.26 
 
 		 172 aa  87.4  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  31.72 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  26.79 
 
 		 207 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  42.06 
 
 		 143 aa  85.5  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  38.32 
 
 		 194 aa  84.7  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  38.32 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  39.8 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  34.51 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  36.45 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  41.49 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  44.57 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  30.77 
 
 		 231 aa  80.9  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  38.57 
 
 		 273 aa  80.9  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  37.14 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  38.98 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  35.14 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  38.94 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  44.19 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  32.35 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 301 aa  77.8  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  33.74 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  36.29 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  40.37 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  32.84 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  33.57 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  38.68 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  37.6 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  38.14 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>