33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0158 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0158  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  45.08 
 
 
326 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2311  putative secreted protein  45.12 
 
 
316 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7334  hypothetical protein  46.53 
 
 
317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8336  Beta-lactamase class A-like protein  42.06 
 
 
315 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4900  hypothetical protein  42.21 
 
 
296 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1541  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.07 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1520  Beta-lactamase class A  33.18 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6105  hypothetical protein  36.95 
 
 
302 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2696  hypothetical protein  37.08 
 
 
325 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.243231  normal  0.199741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4045  hypothetical protein  31.56 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  32.69 
 
 
414 aa  89.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5365  hypothetical protein  30.2 
 
 
253 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2833  hypothetical protein  30.2 
 
 
253 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5325  hypothetical protein  29.7 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5685  hypothetical protein  29.7 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.410744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3689  hypothetical protein  29.7 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0952  beta-lactamase  30.48 
 
 
295 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12919  lipoprotein lppW  32.68 
 
 
314 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.344299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5916  beta-lactamase  29.53 
 
 
310 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545883  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4074  hypothetical protein  29.14 
 
 
311 aa  52.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.78309  normal  0.0391067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  28.05 
 
 
468 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4473  hypothetical protein  29.71 
 
 
303 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  26.98 
 
 
312 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5715  putative alanine rich lipoprotein LppW  30.23 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5425  putative alanine rich lipoprotein LppW  30.23 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5336  putative alanine rich lipoprotein LppW  30.23 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4171  putative alanine rich lipoprotein LppW  28.43 
 
 
312 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5344  hypothetical protein  29.21 
 
 
281 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1949  putative alanine rich lipoprotein LppW  30.05 
 
 
308 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2015  putative alanine rich lipoprotein LppW  30.05 
 
 
308 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1969  putative alanine rich lipoprotein LppW  30.05 
 
 
308 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4075  hypothetical protein  29.03 
 
 
310 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0355781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>