30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8336 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8336  Beta-lactamase class A-like protein  100 
 
 
315 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2311  putative secreted protein  42.45 
 
 
316 aa  149  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  42.86 
 
 
326 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7334  hypothetical protein  42.45 
 
 
317 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0158  hypothetical protein  42.11 
 
 
259 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1541  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.01 
 
 
265 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4900  hypothetical protein  35.34 
 
 
296 aa  95.5  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4045  hypothetical protein  30.53 
 
 
283 aa  92.4  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2696  hypothetical protein  35.32 
 
 
325 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.243231  normal  0.199741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6105  hypothetical protein  34.05 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1520  Beta-lactamase class A  26.69 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  26.64 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5425  putative alanine rich lipoprotein LppW  28.2 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5715  putative alanine rich lipoprotein LppW  28.2 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5336  putative alanine rich lipoprotein LppW  28.2 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  27.62 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5916  beta-lactamase  27.96 
 
 
310 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545883  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0952  beta-lactamase  30.17 
 
 
295 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4171  putative alanine rich lipoprotein LppW  28.88 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1969  putative alanine rich lipoprotein LppW  26.51 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1949  putative alanine rich lipoprotein LppW  26.51 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2015  putative alanine rich lipoprotein LppW  26.51 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5325  hypothetical protein  28.23 
 
 
253 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3689  hypothetical protein  28.23 
 
 
253 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5685  hypothetical protein  28.23 
 
 
253 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.410744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12919  lipoprotein lppW  27.16 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.344299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2833  hypothetical protein  27.63 
 
 
253 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5365  hypothetical protein  27.83 
 
 
253 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4074  hypothetical protein  29.14 
 
 
311 aa  46.2  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.78309  normal  0.0391067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5344  hypothetical protein  27.95 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.292317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>