17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6105 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6105  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  607  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1541  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.81 
 
 
265 aa  95.9  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4045  hypothetical protein  35.53 
 
 
283 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4900  hypothetical protein  34.85 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  33.61 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8336  Beta-lactamase class A-like protein  34.05 
 
 
315 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2311  putative secreted protein  37.44 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7334  hypothetical protein  32.81 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  28.5 
 
 
414 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0158  hypothetical protein  36.45 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2696  hypothetical protein  33.9 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.243231  normal  0.199741 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5325  hypothetical protein  27.51 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3689  hypothetical protein  27.51 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5685  hypothetical protein  27.51 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.410744 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1520  Beta-lactamase class A  25.11 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2833  hypothetical protein  26.2 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5365  hypothetical protein  25.43 
 
 
253 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>