32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7334 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7334  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  618  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  39.79 
 
 
326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0158  hypothetical protein  46.03 
 
 
259 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8336  Beta-lactamase class A-like protein  42.68 
 
 
315 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2311  putative secreted protein  42.31 
 
 
316 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4900  hypothetical protein  38.43 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2696  hypothetical protein  38.2 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.243231  normal  0.199741 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1541  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.25 
 
 
265 aa  113  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1520  Beta-lactamase class A  32.86 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4045  hypothetical protein  30.74 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6105  hypothetical protein  33.2 
 
 
302 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  30.04 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3689  hypothetical protein  32.64 
 
 
253 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5325  hypothetical protein  32.23 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5685  hypothetical protein  32.23 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.410744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2833  hypothetical protein  30.83 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5365  hypothetical protein  30.74 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  25 
 
 
576 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5916  beta-lactamase  30.46 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545883  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5715  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.24 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  31.46 
 
 
312 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5336  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.24 
 
 
310 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5425  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.24 
 
 
310 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4171  putative alanine rich lipoprotein LppW  28.25 
 
 
312 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1949  putative alanine rich lipoprotein LppW  27.13 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2015  putative alanine rich lipoprotein LppW  27.13 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1969  putative alanine rich lipoprotein LppW  27.13 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12919  lipoprotein lppW  27.96 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.344299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0952  beta-lactamase  28.65 
 
 
295 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2675  hypothetical protein  36.61 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000577848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5706  Beta-lactamase  32.56 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338924  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4074  hypothetical protein  25.93 
 
 
311 aa  42.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.78309  normal  0.0391067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>