26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1541 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1541  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 
265 aa  545  1e-154  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4900  hypothetical protein  37.19 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1520  Beta-lactamase class A  37.1 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  33.94 
 
 
326 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0158  hypothetical protein  35.16 
 
 
259 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8336  Beta-lactamase class A-like protein  34.01 
 
 
315 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2311  putative secreted protein  29.13 
 
 
316 aa  99.8  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7334  hypothetical protein  34.25 
 
 
317 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2696  hypothetical protein  35.38 
 
 
325 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.243231  normal  0.199741 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  32.88 
 
 
414 aa  95.5  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6105  hypothetical protein  32.81 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4045  hypothetical protein  28.02 
 
 
283 aa  85.1  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5365  hypothetical protein  27.41 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2833  hypothetical protein  27.37 
 
 
253 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3689  hypothetical protein  26.9 
 
 
253 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5325  hypothetical protein  27.37 
 
 
253 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5685  hypothetical protein  27.37 
 
 
253 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.410744 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  30.18 
 
 
425 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  30.18 
 
 
425 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2719  beta-lactamase  20.53 
 
 
284 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1949  putative alanine rich lipoprotein LppW  21.55 
 
 
308 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2015  putative alanine rich lipoprotein LppW  21.55 
 
 
308 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1969  putative alanine rich lipoprotein LppW  21.55 
 
 
308 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  26.19 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4075  hypothetical protein  25.43 
 
 
310 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0355781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  23.5 
 
 
312 aa  42  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>