31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4900 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4900  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  594  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2696  hypothetical protein  49.06 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.243231  normal  0.199741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4045  hypothetical protein  36.07 
 
 
283 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  41.12 
 
 
326 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2311  putative secreted protein  36.33 
 
 
316 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7334  hypothetical protein  38.43 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0158  hypothetical protein  42.21 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1541  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.19 
 
 
265 aa  116  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  29.72 
 
 
414 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8336  Beta-lactamase class A-like protein  35.34 
 
 
315 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6105  hypothetical protein  34.85 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1520  Beta-lactamase class A  26.82 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4075  hypothetical protein  25.81 
 
 
310 aa  59.3  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0355781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4474  hypothetical protein  28.49 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.334004  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2833  hypothetical protein  29.61 
 
 
253 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5916  beta-lactamase  25.56 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545883  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5365  hypothetical protein  30.61 
 
 
253 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4171  putative alanine rich lipoprotein LppW  26.9 
 
 
312 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3689  hypothetical protein  29.59 
 
 
253 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0952  beta-lactamase  27.35 
 
 
295 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5336  putative alanine rich lipoprotein LppW  24.06 
 
 
310 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5425  putative alanine rich lipoprotein LppW  24.06 
 
 
310 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5325  hypothetical protein  29.08 
 
 
253 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5715  putative alanine rich lipoprotein LppW  24.06 
 
 
310 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5685  hypothetical protein  29.08 
 
 
253 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.410744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  26.26 
 
 
312 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  26.57 
 
 
576 aa  49.7  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4074  hypothetical protein  25 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.78309  normal  0.0391067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4473  hypothetical protein  24.02 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12919  lipoprotein lppW  25 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.344299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2675  hypothetical protein  32.17 
 
 
311 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000577848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>