16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4474 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4474  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.334004  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4075  hypothetical protein  83.33 
 
 
310 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0355781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5344  hypothetical protein  44.79 
 
 
281 aa  196  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4074  hypothetical protein  42.8 
 
 
311 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.78309  normal  0.0391067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4473  hypothetical protein  42.8 
 
 
303 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5715  putative alanine rich lipoprotein LppW  26.67 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5336  putative alanine rich lipoprotein LppW  26.67 
 
 
310 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5425  putative alanine rich lipoprotein LppW  26.67 
 
 
310 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5916  beta-lactamase  26.67 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545883  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4900  hypothetical protein  28.49 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2675  hypothetical protein  26.01 
 
 
311 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000577848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  28.4 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0952  beta-lactamase  27.78 
 
 
295 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4171  putative alanine rich lipoprotein LppW  32.35 
 
 
312 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12919  lipoprotein lppW  25.15 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.344299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  24.28 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>