16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5344 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5344  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  569  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4473  hypothetical protein  51.24 
 
 
303 aa  227  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4074  hypothetical protein  51.88 
 
 
311 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.78309  normal  0.0391067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4474  hypothetical protein  44.79 
 
 
301 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.334004  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4075  hypothetical protein  44.49 
 
 
310 aa  192  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0355781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4045  hypothetical protein  30.54 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5916  beta-lactamase  30.46 
 
 
310 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545883  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5336  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.55 
 
 
310 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5425  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.55 
 
 
310 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5715  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.55 
 
 
310 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  25.41 
 
 
414 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0952  beta-lactamase  29.31 
 
 
295 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2675  hypothetical protein  25.28 
 
 
311 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000577848  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4171  putative alanine rich lipoprotein LppW  27.47 
 
 
312 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  27.96 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8336  Beta-lactamase class A-like protein  27.95 
 
 
315 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>