16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4075 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4075  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  631  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0355781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4474  hypothetical protein  83.33 
 
 		 301 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.334004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5344  hypothetical protein  44.49 
 
 		 281 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4074  hypothetical protein  40.17 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.78309  normal  0.0391067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4473  hypothetical protein  40.6 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2675  hypothetical protein  28.9 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000577848  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4900  hypothetical protein  26.27 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5916  beta-lactamase  27.27 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  30.18 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0952  beta-lactamase  27.78 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  26.44 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4171  putative alanine rich lipoprotein LppW  25.26 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12919  lipoprotein lppW  23.36 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.344299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1969  putative alanine rich lipoprotein LppW  22.34 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2015  putative alanine rich lipoprotein LppW  22.34 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1949  putative alanine rich lipoprotein LppW  22.34 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>