27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4074 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4074  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  629  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.78309  normal  0.0391067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4473  hypothetical protein  87.79 
 
 		 303 aa  529  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5344  hypothetical protein  50.83 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4474  hypothetical protein  38.73 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.334004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4075  hypothetical protein  36.66 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0355781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5336  putative alanine rich lipoprotein LppW  26.45 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5425  putative alanine rich lipoprotein LppW  26.45 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5715  putative alanine rich lipoprotein LppW  26.45 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0952  beta-lactamase  30.73 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2675  hypothetical protein  26.15 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000577848  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  28.34 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5916  beta-lactamase  26.81 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4171  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.63 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4900  hypothetical protein  25.27 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1949  putative alanine rich lipoprotein LppW  25.47 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2015  putative alanine rich lipoprotein LppW  25.47 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1969  putative alanine rich lipoprotein LppW  25.47 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2311  putative secreted protein  31.06 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12919  lipoprotein lppW  25.72 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.344299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8336  Beta-lactamase class A-like protein  29.14 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5325  hypothetical protein  23.51 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3689  hypothetical protein  23.51 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5685  hypothetical protein  23.51 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.410744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7334  hypothetical protein  25 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  25.54 
 
 		 414 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2696  hypothetical protein  26.32 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.243231  normal  0.199741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  26.4 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>