25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1969 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1969  putative alanine rich lipoprotein LppW  100 
 
 
308 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2015  putative alanine rich lipoprotein LppW  100 
 
 
308 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1949  putative alanine rich lipoprotein LppW  100 
 
 
308 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  67.95 
 
 
312 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4171  putative alanine rich lipoprotein LppW  68.59 
 
 
312 aa  374  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12919  lipoprotein lppW  59.57 
 
 
314 aa  342  5e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.344299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5336  putative alanine rich lipoprotein LppW  59.42 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5425  putative alanine rich lipoprotein LppW  59.42 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5715  putative alanine rich lipoprotein LppW  59.42 
 
 
310 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5916  beta-lactamase  60.26 
 
 
310 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545883  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0952  beta-lactamase  53.56 
 
 
295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2719  beta-lactamase  36.95 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2675  hypothetical protein  33.75 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000577848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  29.59 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2311  putative secreted protein  30.22 
 
 
316 aa  63.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5365  hypothetical protein  28.39 
 
 
253 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5325  hypothetical protein  28.78 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5685  hypothetical protein  28.78 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.410744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3689  hypothetical protein  28.78 
 
 
253 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2833  hypothetical protein  28.29 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8336  Beta-lactamase class A-like protein  26.42 
 
 
315 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4473  hypothetical protein  26.14 
 
 
303 aa  49.3  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4074  hypothetical protein  25.84 
 
 
311 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.78309  normal  0.0391067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7334  hypothetical protein  25.97 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1541  penicillin-binding protein, transpeptidase  21.28 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>