36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2311 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2311  putative secreted protein  100 
 
 		 316 aa  626  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  45.45 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8336  Beta-lactamase class A-like protein  42.45 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0158  hypothetical protein  44.49 
 
 		 259 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7334  hypothetical protein  41.39 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4900  hypothetical protein  36.33 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1541  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.29 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2696  hypothetical protein  39.7 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.243231  normal  0.199741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4045  hypothetical protein  30.28 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6105  hypothetical protein  37.44 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1949  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.48 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1969  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.48 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2015  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.48 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0952  beta-lactamase  28.57 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1520  Beta-lactamase class A  25.73 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  28.19 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  28.82 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12919  lipoprotein lppW  29.52 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.344299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5715  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.71 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5425  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.35 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5336  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.35 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5916  beta-lactamase  27.27 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3689  hypothetical protein  28.63 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5325  hypothetical protein  28.63 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5685  hypothetical protein  28.63 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.410744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2833  hypothetical protein  28.94 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5365  hypothetical protein  29.41 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4075  hypothetical protein  26.89 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0355781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4474  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.334004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4074  hypothetical protein  29.82 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.78309  normal  0.0391067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2719  beta-lactamase  39.8 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4171  putative alanine rich lipoprotein LppW  28.72 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4473  hypothetical protein  28.27 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  25.74 
 
 		 576 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1476  hypothetical protein  27.83 
 
 		 496 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  38.05 
 
 		 375 aa  42.7  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>