35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0507 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  100 
 
 		 326 aa  647    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2311  putative secreted protein  48.77 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0158  hypothetical protein  45.08 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7334  hypothetical protein  40 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8336  Beta-lactamase class A-like protein  42.86 
 
 		 315 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4900  hypothetical protein  41.12 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2696  hypothetical protein  41.4 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.243231  normal  0.199741 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1541  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.53 
 
 		 265 aa  114  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4045  hypothetical protein  35.19 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1520  Beta-lactamase class A  30.21 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6105  hypothetical protein  33.61 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5685  hypothetical protein  31.87 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.410744 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5325  hypothetical protein  31.87 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3689  hypothetical protein  31.87 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  28.45 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2833  hypothetical protein  32.16 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5916  beta-lactamase  30.65 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5365  hypothetical protein  30.68 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12919  lipoprotein lppW  31.52 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.344299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1969  putative alanine rich lipoprotein LppW  28.84 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1949  putative alanine rich lipoprotein LppW  28.84 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2015  putative alanine rich lipoprotein LppW  28.84 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5715  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.96 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0952  beta-lactamase  28.71 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  27.64 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5425  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.52 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5336  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.52 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2719  beta-lactamase  32.61 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4171  putative alanine rich lipoprotein LppW  27.5 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4474  hypothetical protein  28.08 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.334004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4075  hypothetical protein  27.31 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0355781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  24.44 
 
 		 576 aa  45.8  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  25 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  25.56 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  25.57 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>