19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4045 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4045  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4900  hypothetical protein  36.07 
 
 
296 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2696  hypothetical protein  34.68 
 
 
325 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.243231  normal  0.199741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  35.19 
 
 
326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6105  hypothetical protein  35.53 
 
 
302 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2311  putative secreted protein  31.2 
 
 
316 aa  92  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8336  Beta-lactamase class A-like protein  31.17 
 
 
315 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  28.97 
 
 
414 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1541  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.02 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0158  hypothetical protein  31.56 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3689  hypothetical protein  29.46 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2833  hypothetical protein  29.05 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5365  hypothetical protein  29.05 
 
 
253 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5325  hypothetical protein  29.05 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5685  hypothetical protein  29.05 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.410744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7334  hypothetical protein  29.87 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1520  Beta-lactamase class A  29.08 
 
 
297 aa  62.8  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5344  hypothetical protein  30.54 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  25.3 
 
 
333 aa  49.7  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>