14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5947 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5947  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  706    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1746  hypothetical protein  43.57 
 
 		 337 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.470795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5341  hypothetical protein  39.67 
 
 		 350 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  24.71 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  23.08 
 
 		 286 aa  53.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  23.38 
 
 		 803 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  23.4 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  23.4 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  28.03 
 
 		 442 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  25.3 
 
 		 508 aa  47  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  22.89 
 
 		 292 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  25.75 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  23.96 
 
 		 468 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.93 
 
 		 504 aa  42.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>