20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1250 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1250  hypothetical protein  100 
 
 
504 aa  1014    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2152  hypothetical protein  45.51 
 
 
513 aa  365  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0167915  hitchhiker  0.00298164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3023  hypothetical protein  47.19 
 
 
516 aa  346  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698448  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1476  hypothetical protein  34.52 
 
 
496 aa  244  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  25.47 
 
 
576 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  26.13 
 
 
353 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  23.85 
 
 
323 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  23.3 
 
 
424 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  23.37 
 
 
292 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  24.14 
 
 
304 aa  57.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.08 
 
 
422 aa  53.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  21.11 
 
 
286 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  36.26 
 
 
282 aa  50.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  24 
 
 
504 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  29.41 
 
 
442 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  22.1 
 
 
440 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  20.95 
 
 
300 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  35.63 
 
 
283 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  24.52 
 
 
508 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4909  VanW family protein  30.34 
 
 
633 aa  43.9  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>