27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3960 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3960  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  571  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  66.21 
 
 		 302 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  66.21 
 
 		 305 aa  358  6e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1458  beta-lactamase  66.67 
 
 		 306 aa  357  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3301  beta-lactamase  45.77 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  36.17 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  31.08 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  29.59 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  32.28 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  27.21 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  34.15 
 
 		 576 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  28.75 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  29.51 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  34.93 
 
 		 327 aa  53.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  28.57 
 
 		 306 aa  52.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  25.98 
 
 		 383 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  24.35 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2988  Beta-lactamase class A-like protein  28.57 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  24.35 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  27.11 
 
 		 436 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  23.66 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  25.18 
 
 		 287 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  24.32 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4022  D-alanyl-D-alaninecarboxypeptidase/D-alanyl-D- al anine-endopeptidase  36 
 
 		 465 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  25.36 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  26.09 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  27.24 
 
 		 353 aa  42.4  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>