17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3441 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3441  Beta-lactamase class A-like protein  100 
 
 		 347 aa  718    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  25.08 
 
 		 803 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  29.02 
 
 		 576 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  25.51 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  25 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  23.32 
 
 		 468 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  24.71 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.32 
 
 		 422 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  30.95 
 
 		 302 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  23.25 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  25 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  20.17 
 
 		 259 aa  50.1  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  20.17 
 
 		 259 aa  50.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  22.22 
 
 		 425 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  20.47 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  22.22 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  31.91 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>