38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3839 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3839  Beta-lactamase class A-like  100 
 
 
402 aa  820    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1820  hypothetical protein  26.23 
 
 
363 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.549767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1578  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.23 
 
 
363 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1793  hypothetical protein  25.93 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1874  hypothetical protein  25.93 
 
 
363 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1569  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.93 
 
 
363 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2225  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.69 
 
 
369 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0645654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1618  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.3 
 
 
363 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1617  hypothetical protein  25.62 
 
 
363 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.482442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1743  hypothetical protein  25.62 
 
 
363 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1760  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.49 
 
 
363 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1402  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.59 
 
 
362 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3583  hypothetical protein  25.16 
 
 
363 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1495  hypothetical protein  27.69 
 
 
390 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3558  hypothetical protein  24.02 
 
 
369 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000125985 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3259  hypothetical protein  24.02 
 
 
369 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3309  hypothetical protein  24.02 
 
 
369 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0370218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3344  hypothetical protein  24.02 
 
 
369 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3605  hypothetical protein  24.02 
 
 
359 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0681619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3253  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.41 
 
 
369 aa  96.3  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.309405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1659  hypothetical protein  24.02 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000949854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3658  hypothetical protein  24.02 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3565  hypothetical protein  23.72 
 
 
359 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3568  hypothetical protein  23.42 
 
 
359 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3627  hypothetical protein  36.26 
 
 
332 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  23.64 
 
 
443 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  23.64 
 
 
443 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  23.33 
 
 
443 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1343  hypothetical protein  31.72 
 
 
332 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  24.16 
 
 
452 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  30.77 
 
 
292 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  28.57 
 
 
452 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  31.62 
 
 
454 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  28.03 
 
 
296 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1291  beta-lactamase, putative  29.79 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  35.24 
 
 
282 aa  46.6  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  31.4 
 
 
356 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  28.87 
 
 
266 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>