22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1291 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1291  beta-lactamase, putative  100 
 
 		 387 aa  788    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  35.25 
 
 		 292 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  28.93 
 
 		 452 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  37.04 
 
 		 356 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  28.28 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  28.38 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  38.14 
 
 		 266 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  36.89 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3839  Beta-lactamase class A-like  29.79 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6760  Beta-lactamase class A-like protein  37.76 
 
 		 271 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  38.04 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  34.82 
 
 		 576 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  28.36 
 
 		 300 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  31.62 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  33.96 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  29.9 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  29.9 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  29.9 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  32.5 
 
 		 293 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  34.09 
 
 		 508 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  39.29 
 
 		 458 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2988  Beta-lactamase class A-like protein  31.58 
 
 		 286 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  normal  0.0212665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>