16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1090 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1090  putative beta-lactamase  100 
 
 		 443 aa  885    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  35.53 
 
 		 390 aa  170  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  32.72 
 
 		 458 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  34.75 
 
 		 399 aa  159  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  34.91 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  27.68 
 
 		 443 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  27.68 
 
 		 443 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  27.84 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  29.27 
 
 		 452 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  27.27 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  32.49 
 
 		 453 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  27.58 
 
 		 454 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  28.3 
 
 		 424 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  35.23 
 
 		 292 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  32.2 
 
 		 283 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  29.91 
 
 		 349 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>