26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6760 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6760  Beta-lactamase class A-like protein  100 
 
 		 271 aa  521  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  56.8 
 
 		 266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  32.29 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  38.61 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  32.11 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  29.7 
 
 		 383 aa  52.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  37.76 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  28.05 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  30.41 
 
 		 300 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1291  beta-lactamase, putative  37.76 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  31.05 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  38.82 
 
 		 442 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  33.05 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  33.05 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  29.57 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  23.7 
 
 		 424 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  35.11 
 
 		 452 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  31.69 
 
 		 424 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3689  Beta-lactamase  31.63 
 
 		 302 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248785  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  38.14 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  31.53 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  31.53 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  31.53 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  31.9 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1856  Beta-lactamase class A  41.51 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000412045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  37.35 
 
 		 508 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>