115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4082 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4082  Beta-lactamase  100 
 
 		 292 aa  559  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0136649 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  54.33 
 
 		 304 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  49.83 
 
 		 296 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  53.77 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4439  putative Beta-lactamase  52.38 
 
 		 288 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  49.64 
 
 		 300 aa  255  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  55.04 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  51.99 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1164  Beta-lactamase  54.65 
 
 		 300 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1390  Beta-lactamase  53.45 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585114  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0366  Beta-lactamase  55.74 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385843  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  50.71 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4009  Beta-lactamase  53.23 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  53.54 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  47.06 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0088  Beta-lactamase  49.1 
 
 		 291 aa  238  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3231  Beta-lactamase  52.61 
 
 		 299 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  52.48 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  51.67 
 
 		 304 aa  234  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  52.48 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  52.48 
 
 		 314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  52.07 
 
 		 295 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  52.07 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  52.07 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  52.07 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1450  class A beta-lactamase precursor  51.38 
 
 		 322 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3689  Beta-lactamase  53.31 
 
 		 302 aa  231  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248785  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  52.61 
 
 		 296 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  52.21 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1684  Beta-lactamase  49.19 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132046  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  48.12 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  52.56 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4360  Beta-lactamase  50 
 
 		 297 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000108699  unclonable  0.00000562292 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  48.43 
 
 		 312 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  48.63 
 
 		 312 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4877  Beta-lactamase  46.91 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00066031  hitchhiker  0.000000000265752 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0762  Beta-lactamase  47.84 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0608621  hitchhiker  0.000417556 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  45.52 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  45.52 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  45.52 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3438  Beta-lactamase  48.03 
 
 		 312 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000252783  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  51.5 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1435  Beta-lactamase  44.68 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  48.26 
 
 		 301 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2229  Beta-lactamase  44.06 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0753416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2820  Beta-lactamase  44.92 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.893397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  44.14 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3136  Beta-lactamase  46.04 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570574  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12104  class A beta-lactamase blaC  45.15 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  46.06 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  46.06 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  46.06 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  42.96 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2331  Beta-lactamase  39.44 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000573292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2595  beta-lactamase Bla1  37.7 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  39.3 
 
 		 319 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2328  beta-lactamase  37.5 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2291  beta-lactamase  37.5 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000475261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2507  beta-lactamase  37.5 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2522  beta-lactamase Bla1  37.88 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102568 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2539  beta-lactamase  37.3 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000363771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2247  beta-lactamase  37.12 
 
 		 309 aa  175  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2503  beta-lactamase  33 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2820  beta-lactamase Bla1  33.88 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5163  Beta-lactamase  47.12 
 
 		 322 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0157119 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001392  beta-lactamase  37.31 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000730239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  40.34 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  40.77 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  42.46 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5706  Beta-lactamase  43.28 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06370  beta-lactamase  37.26 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1245  Beta-lactamase  42.12 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0809  Beta-lactamase  39.48 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  46.52 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3769  Beta-lactamase  44.44 
 
 		 332 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4599  Beta-lactamase  44.44 
 
 		 332 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1457  Beta-lactamase  40.83 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1418  Beta-lactamase  42.92 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732214  hitchhiker  0.0000172267 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5706  Beta-lactamase  43.65 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0394955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2389  Beta-lactamase  41.1 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172194  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4029  Beta-lactamase  45.18 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4048  Beta-lactamase  42.18 
 
 		 314 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.94661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2388  Beta-lactamase  38.65 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327196  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1245  beta-lactamase  36.05 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4487  Beta-lactamase  45.37 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.745574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2178  Beta-lactamase  39.83 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198919  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3962  Beta-lactamase  39.33 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3299  Beta-lactamase  36.47 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  27.64 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  27.64 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1461  beta-lactamase  26.04 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000606935  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  26.32 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  34.58 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  30.62 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  30.98 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  34.32 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  32.09 
 
 		 334 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  32.95 
 
 		 418 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  28.77 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  30.14 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>