14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26600 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_26600  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  783    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.61546  normal  0.94722 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2363  hypothetical protein  30.77 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  26.38 
 
 
576 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  24.82 
 
 
613 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  30.36 
 
 
327 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  23.61 
 
 
468 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  25.55 
 
 
440 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.2 
 
 
422 aa  46.6  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  25.17 
 
 
508 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  29.51 
 
 
259 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  29.51 
 
 
259 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  27.94 
 
 
304 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  29.2 
 
 
353 aa  43.1  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  28.57 
 
 
291 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>