More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1660 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1081  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  98.8 
 
 
333 aa  659    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.40772  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0238  peptidase  100 
 
 
333 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1748  peptidase  99.4 
 
 
333 aa  662    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429918  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1660  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  100 
 
 
333 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0344  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  98.8 
 
 
333 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1242  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  98.8 
 
 
333 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0745772  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0075  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  95.12 
 
 
511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0411  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  46.13 
 
 
438 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0177027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0225  penicillin-binding protein 6  46.85 
 
 
397 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2903  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  44.57 
 
 
436 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2893  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  44.57 
 
 
436 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2278  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  45.88 
 
 
529 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0280  penicillin-binding protein 6  47.24 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0327  penicillin-binding transmembrane protein  44.48 
 
 
397 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6236  penicillin-binding protein 6  43.82 
 
 
437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2805  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  44.36 
 
 
437 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.816207  normal  0.794908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2943  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  44.19 
 
 
436 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0183  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  42.61 
 
 
400 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0189  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  42.61 
 
 
400 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0133986  normal  0.43472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0498  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  45.35 
 
 
409 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0047366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4218  penicillin-binding protein 6  46.12 
 
 
418 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0380  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  45.31 
 
 
436 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0620  penicillin-binding protein 6  45.31 
 
 
437 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.696128  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0458  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  45.31 
 
 
437 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.980224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3192  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  45.31 
 
 
437 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0438  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  45.31 
 
 
437 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1369  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  45.31 
 
 
437 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0224  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  45.31 
 
 
437 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0058  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  45.14 
 
 
403 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0212  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  44.06 
 
 
409 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0242  Beta-lactamase  44.19 
 
 
375 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.984857  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1635  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.11 
 
 
396 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137172  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1408  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  44.03 
 
 
418 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000562956  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1345  D-alanyl-D-alanine serine-type carboxypeptidase  44.03 
 
 
418 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000062707  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1517  hypothetical protein  42.23 
 
 
430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0291  penicillin-binding protein 6  41.7 
 
 
391 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1549  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.24 
 
 
359 aa  216  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1466  hypothetical protein  41.83 
 
 
430 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0385  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  42.59 
 
 
389 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235008  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1991  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.57 
 
 
404 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0618  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  42.55 
 
 
386 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143344  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0250  penicillin-binding protein 6  41.67 
 
 
400 aa  208  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000463975  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4821  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  41.61 
 
 
386 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4361  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.03 
 
 
395 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0572554  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4678  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  42.18 
 
 
403 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.526181  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0332  penicillin-binding protein 6  42.26 
 
 
393 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4856  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.82 
 
 
386 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399898  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3640  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  45.34 
 
 
298 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.683298  normal  0.376375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4803  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  42.18 
 
 
386 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.273378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4966  penicillin-binding protein 6  42.25 
 
 
385 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0197  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.53 
 
 
402 aa  206  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00107938  normal  0.937465 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4237  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.01 
 
 
389 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2410  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.63 
 
 
391 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2844  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.13 
 
 
382 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000202548  hitchhiker  0.000178418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0105  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  39.34 
 
 
392 aa  203  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4921  Beta-lactamase  41.35 
 
 
389 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1110  D-ala-D-ala-carboxypeptidase  41.57 
 
 
386 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12100  D-ala-D-ala-carboxypeptidase  41.57 
 
 
386 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1254  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.04 
 
 
402 aa  202  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.814321  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3337  penicillin-binding protein 6  39.08 
 
 
393 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000146078  normal  0.0197837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2497  penicillin-binding protein 6  41.18 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0920  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.31 
 
 
414 aa  199  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08430  D-Alanyl-D-Alanine carboxypeptidase  41.25 
 
 
404 aa  198  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000566286  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3794  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.49 
 
 
386 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0272  penicillin-binding protein 6  37.88 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0245093  hitchhiker  0.00000225718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0267  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.88 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000362711  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0176  penicillin-binding protein 6  40.89 
 
 
381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2740  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.61 
 
 
401 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1549  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  39.61 
 
 
401 aa  196  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0311  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.5 
 
 
384 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  decreased coverage  0.00122162 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2632  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.16 
 
 
382 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2659  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  39.22 
 
 
400 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3801  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.11 
 
 
394 aa  192  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000264221  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1362  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.37 
 
 
396 aa  192  8e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04285  penicillin-binding protein 6  37.5 
 
 
401 aa  192  9e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01652  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  36.92 
 
 
394 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000184002  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1704  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.15 
 
 
388 aa  189  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.369344  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3446  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.21 
 
 
406 aa  188  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.601063 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.28 
 
 
406 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2295  Beta-lactamase  38.99 
 
 
401 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1012  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.93 
 
 
392 aa  186  7e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.56176  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1970  Beta-lactamase  40.15 
 
 
415 aa  185  9e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.714135  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2578  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  40.07 
 
 
394 aa  185  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0328137 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1267  Beta-lactamase  37.69 
 
 
425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00143172  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2148  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  40.21 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0098  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  39.09 
 
 
368 aa  182  5.0000000000000004e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0470  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  35.66 
 
 
391 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000348683  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001131  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  34.69 
 
 
385 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.887939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1363  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.18 
 
 
326 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0597561  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0695  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.62 
 
 
403 aa  182  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2939  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.27 
 
 
390 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000023213  normal  0.0234348 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2395  Beta-lactamase  37.5 
 
 
402 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2707  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.84 
 
 
391 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0960  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  36.96 
 
 
389 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2232  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  38.98 
 
 
390 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0710384  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1630  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  39.86 
 
 
388 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0647  serine-type D-ala-D-ala-carboxypeptidase  39.52 
 
 
402 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2155  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.68 
 
 
404 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01214  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  35.66 
 
 
392 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0992  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction C  36.82 
 
 
403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal  0.226305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>