More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2923 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2923  beta-lactamase  100 
 
 		 423 aa  862    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.633134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  28.5 
 
 		 384 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  26.39 
 
 		 511 aa  143  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3049  beta-lactamase  30.7 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.918647  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.57 
 
 		 601 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  28.94 
 
 		 613 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  36.22 
 
 		 635 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  26.75 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  29.22 
 
 		 633 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  34.81 
 
 		 357 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  32.55 
 
 		 661 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  32.95 
 
 		 658 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  30.85 
 
 		 614 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  36.54 
 
 		 478 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  29.27 
 
 		 353 aa  87.8  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  26.38 
 
 		 422 aa  86.7  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  32.45 
 
 		 566 aa  86.3  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  29.74 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  33.89 
 
 		 674 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  29.5 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.14 
 
 		 533 aa  85.9  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  32.95 
 
 		 657 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  29.12 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  31.31 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  25.81 
 
 		 574 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  28.65 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  29.12 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  28.7 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  28.77 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  30.57 
 
 		 476 aa  83.2  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  24.11 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  32.43 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  33.85 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  29.12 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  27.69 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2275  beta-lactamase  35.47 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0956783 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  25.71 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  31.3 
 
 		 695 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  27.69 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  28.42 
 
 		 513 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  27.69 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  30.38 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  28.42 
 
 		 513 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  32.6 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  28.23 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  31.84 
 
 		 588 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  26.38 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  27.69 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.05 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.4 
 
 		 834 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  31.55 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  25.82 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.72 
 
 		 559 aa  78.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  29.78 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  24.92 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  28.89 
 
 		 662 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.23 
 
 		 595 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  25.07 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  31.58 
 
 		 677 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  23.85 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  30.11 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5620  beta-lactamase  28.08 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141617  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  23.2 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  23.96 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  26.58 
 
 		 669 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  27.89 
 
 		 513 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  27.13 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  28.41 
 
 		 543 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  26.67 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  30.65 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  28.41 
 
 		 543 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  26.16 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  28.87 
 
 		 670 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  31.25 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.49 
 
 		 578 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  30.16 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  30.19 
 
 		 528 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  31.02 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  30.19 
 
 		 528 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  24.89 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  31.66 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  29.5 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  29.12 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  29.5 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  25.32 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  25.64 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  26.03 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  32.96 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  26.79 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  25.84 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.15 
 
 		 1055 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  34.41 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  31.58 
 
 		 848 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.25 
 
 		 582 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33.33 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  30.81 
 
 		 555 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  23.59 
 
 		 650 aa  73.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  25.84 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  28.85 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.33 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>