More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5620 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5620  beta-lactamase  100 
 
 
417 aa  848    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141617  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6028  beta-lactamase  68.45 
 
 
438 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.198472  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4797  beta-lactamase  47.56 
 
 
440 aa  329  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2213  beta-lactamase  35.51 
 
 
380 aa  182  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  33.25 
 
 
862 aa  176  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6294  beta-lactamase  35.63 
 
 
394 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  31.98 
 
 
933 aa  153  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5564  beta-lactamase  29.69 
 
 
693 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  29.75 
 
 
363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  31.37 
 
 
463 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.97 
 
 
487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  26.97 
 
 
578 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.47 
 
 
442 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.44 
 
 
446 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.3 
 
 
446 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  28.26 
 
 
377 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  31.58 
 
 
456 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.62 
 
 
392 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  27.94 
 
 
370 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.62 
 
 
445 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.09 
 
 
477 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  29.08 
 
 
669 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.75 
 
 
388 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  28.62 
 
 
434 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  26.37 
 
 
388 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.53 
 
 
342 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  28.5 
 
 
369 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.92 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.57 
 
 
476 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  27.01 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  25.75 
 
 
462 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  27.01 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  27.31 
 
 
388 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  34.52 
 
 
611 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  27.31 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.07 
 
 
389 aa  97.8  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  28.57 
 
 
486 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  27.51 
 
 
415 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  26.94 
 
 
388 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  36.79 
 
 
488 aa  97.1  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  26.63 
 
 
421 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  26.93 
 
 
529 aa  96.7  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  26.69 
 
 
388 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  31.82 
 
 
658 aa  96.3  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  26.63 
 
 
412 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  26.63 
 
 
412 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  27.27 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.33 
 
 
681 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  29.85 
 
 
505 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.63 
 
 
422 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.27 
 
 
364 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  29.08 
 
 
657 aa  95.5  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  27.14 
 
 
416 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  31.19 
 
 
450 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  32.11 
 
 
470 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  27.3 
 
 
519 aa  94.4  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  35.16 
 
 
603 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  27.01 
 
 
362 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  27.38 
 
 
740 aa  94  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  29.67 
 
 
453 aa  93.6  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  31.15 
 
 
416 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.71 
 
 
593 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  27.91 
 
 
778 aa  93.2  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  30.85 
 
 
695 aa  93.2  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  32.97 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.26 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  29.05 
 
 
404 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  26.92 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  26.39 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  28.66 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33.94 
 
 
508 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.14 
 
 
533 aa  92  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  29.6 
 
 
442 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  27.5 
 
 
409 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  24.61 
 
 
422 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  27.47 
 
 
356 aa  90.5  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  29.85 
 
 
419 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  28.78 
 
 
330 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  30.29 
 
 
614 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  24.5 
 
 
691 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  24.5 
 
 
691 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  25.95 
 
 
437 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.21 
 
 
484 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  31.16 
 
 
650 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  24.21 
 
 
691 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  24.36 
 
 
691 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  26.38 
 
 
524 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  28.03 
 
 
635 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  32.64 
 
 
633 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  24.4 
 
 
419 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  26.1 
 
 
483 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  29.64 
 
 
543 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  25.15 
 
 
691 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  29.64 
 
 
543 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  25.65 
 
 
501 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.94 
 
 
539 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  30.43 
 
 
457 aa  87.4  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.07 
 
 
559 aa  87.4  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  24.36 
 
 
691 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  32.08 
 
 
496 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>