More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3049 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3049  beta-lactamase  100 
 
 		 357 aa  719    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.918647  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2923  beta-lactamase  30.7 
 
 		 423 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.633134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  23.03 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  33.58 
 
 		 578 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  24.65 
 
 		 511 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  32.02 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.95 
 
 		 487 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.48 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  30.6 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  29.12 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  28.65 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  33.15 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.88 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0459  beta-lactamase  33.78 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.08 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  28.27 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  32.33 
 
 		 603 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  30.41 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.19 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  32.33 
 
 		 593 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  31.78 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  32.97 
 
 		 416 aa  62.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  30.46 
 
 		 494 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  30.61 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  32.59 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  29.31 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3866  beta-lactamase  23.9 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  32.33 
 
 		 611 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  30.81 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  28.51 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.79 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  29.95 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  24.87 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  24.74 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2188  beta-lactamase  32.5 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  30.2 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  24.74 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  24.74 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0275  beta-lactamase  35.82 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.35061  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  24.74 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  29.8 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.37 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  27.61 
 
 		 481 aa  59.7  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.41 
 
 		 508 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  24.74 
 
 		 483 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.57 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  31.3 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  31.08 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.3 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  33.33 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.3 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.68 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.39 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  31.72 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  33.06 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.32 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  28.09 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  32.33 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  29.14 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.07 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  26.19 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  30.53 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  30.25 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4697  beta-lactamase  26.14 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.168974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.19 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  22.67 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1013  beta-lactamase  31.03 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  32.14 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  31.15 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  28.99 
 
 		 483 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  25.95 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.43 
 
 		 429 aa  57  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  23.47 
 
 		 384 aa  57  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  29.8 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  26.97 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  34.56 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  32.47 
 
 		 483 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.34 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.14 
 
 		 407 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  33.04 
 
 		 442 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  32.39 
 
 		 600 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  30.22 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.15 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  28.89 
 
 		 610 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  35.65 
 
 		 560 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.28 
 
 		 453 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.15 
 
 		 388 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  25.95 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  29.71 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  27.34 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.06 
 
 		 514 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  30.6 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  28.4 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  29.83 
 
 		 496 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  26.04 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  25.6 
 
 		 388 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  38.58 
 
 		 513 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 785 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.9 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  31.21 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>