More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2188 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2188  beta-lactamase  100 
 
 		 421 aa  861    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0459  beta-lactamase  48.79 
 
 		 415 aa  342  5.999999999999999e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2315  beta-lactamase  44.99 
 
 		 440 aa  289  8e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00477679  hitchhiker  0.0000358597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3510  beta-lactamase  44.94 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3243  beta-lactamase  44.54 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3305  beta-lactamase  44.54 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0079678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3254  beta-lactamase  44.54 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3689  beta-lactamase  40.38 
 
 		 422 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4733  beta-lactamase  41.11 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10404  lipoprotein lpqK  40.58 
 
 		 409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  31.07 
 
 		 713 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.1 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.51 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  33.33 
 
 		 720 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.33 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  30.74 
 
 		 375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.13 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  30.28 
 
 		 388 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  26.29 
 
 		 388 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  26.55 
 
 		 388 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  33.63 
 
 		 383 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  29.25 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  26.89 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.27 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  31.27 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  31.27 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  36.82 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  29.78 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.03 
 
 		 388 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  27.94 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.35 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  29.58 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.79 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.77 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  29.93 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.81 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.79 
 
 		 385 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  33.18 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  29.54 
 
 		 443 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  32.62 
 
 		 370 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.29 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.41 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  29.79 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  29.44 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.85 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.06 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.23 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  29.26 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  28.77 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  28.7 
 
 		 388 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  28.7 
 
 		 388 aa  100  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.7 
 
 		 388 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  28.7 
 
 		 388 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.96 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 		 447 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.78 
 
 		 447 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.52 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  28.68 
 
 		 2457 aa  97.8  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.25 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.97 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  30.7 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.35 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.56 
 
 		 487 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  31.28 
 
 		 459 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  29.49 
 
 		 420 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  27 
 
 		 416 aa  93.6  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.46 
 
 		 420 aa  93.2  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.17 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  26.83 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  24.74 
 
 		 482 aa  90.5  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  30.86 
 
 		 431 aa  90.5  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.35 
 
 		 420 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  25.93 
 
 		 442 aa  90.1  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.05 
 
 		 405 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1885  hypothetical protein  26.73 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  29.22 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.01 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1013  beta-lactamase  25.86 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.01 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1874  hypothetical protein  26.73 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.43 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  28.05 
 
 		 477 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  28.97 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.41 
 
 		 438 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  30.39 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.87 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0467  beta-lactamase  33.33 
 
 		 381 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  decreased coverage  0.000353045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.96 
 
 		 383 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  30.92 
 
 		 740 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1378  beta-lactamase  30.61 
 
 		 337 aa  87.4  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.389159  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2537  beta-lactamase  25.78 
 
 		 393 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.1 
 
 		 411 aa  86.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  30.67 
 
 		 449 aa  86.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.09 
 
 		 414 aa  86.3  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  29.1 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  27.76 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.41 
 
 		 514 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  27.27 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  30.36 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>