More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3246 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3246  D-aminopeptidase  100 
 
 		 516 aa  1039    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3981  D-aminopeptidase  98.26 
 
 		 516 aa  1020    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0947  D-aminopeptidase  49.33 
 
 		 518 aa  498  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0889  D-aminopeptidase  49.14 
 
 		 518 aa  495  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1412  D-aminopeptidase  48.36 
 
 		 520 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  30.23 
 
 		 537 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  26.51 
 
 		 547 aa  123  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  26.76 
 
 		 543 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  24.68 
 
 		 543 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  23.66 
 
 		 559 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  24.68 
 
 		 543 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.33 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  28.36 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  26.71 
 
 		 410 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.25 
 
 		 342 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  24.93 
 
 		 477 aa  97.1  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  29.13 
 
 		 445 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  29.06 
 
 		 338 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  25.16 
 
 		 364 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  22.78 
 
 		 364 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  27.16 
 
 		 713 aa  91.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  28.03 
 
 		 519 aa  91.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.3 
 
 		 442 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  26.6 
 
 		 371 aa  91.3  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  26.28 
 
 		 371 aa  90.9  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.18 
 
 		 470 aa  90.1  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  29.25 
 
 		 356 aa  89.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  25.41 
 
 		 498 aa  87.4  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  24.67 
 
 		 351 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  28.21 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  26.73 
 
 		 848 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3988  beta-lactamase  23.98 
 
 		 503 aa  85.9  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.05 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  23.44 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  27.65 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  23.74 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  23.99 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  24.89 
 
 		 834 aa  83.6  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.8 
 
 		 510 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  23.44 
 
 		 481 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  22.92 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.62 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  22.92 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2075  beta-lactamase  23.53 
 
 		 511 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  26.26 
 
 		 803 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.69 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  24.63 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  24.93 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  25.16 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0140  beta-lactamase  23.29 
 
 		 503 aa  80.9  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.877778  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  25.22 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  22.96 
 
 		 417 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  21.65 
 
 		 403 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  24.71 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  21.94 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.35 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  26.28 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  29.44 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  26.28 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  27.05 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  28.14 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  26.25 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  26.11 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  25 
 
 		 529 aa  78.2  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  23.69 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  28.57 
 
 		 637 aa  77.4  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  22.22 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  24.33 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  24.48 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  25.91 
 
 		 412 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  22.05 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.78 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.55 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.05 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.78 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  22.51 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  23.19 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  24.78 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  26.73 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  24.78 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  24.7 
 
 		 681 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.37 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  25 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  24.32 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  24.32 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  24.32 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.22 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  25.46 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  24.32 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  23.05 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  21.83 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.43 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  25.54 
 
 		 603 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  25.15 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.09 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  28.5 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  25.54 
 
 		 593 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  23.13 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  23.42 
 
 		 526 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.09 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>