15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2259 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2259  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 713 aa  1475    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1204  hypothetical protein  48.32 
 
 		 782 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.980122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  37.08 
 
 		 755 aa  64.3  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  32.56 
 
 		 554 aa  55.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  40.7 
 
 		 511 aa  51.2  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.47 
 
 		 809 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  27.22 
 
 		 1255 aa  48.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1855  Carbohydrate binding family 6  30.22 
 
 		 892 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  31.91 
 
 		 918 aa  47.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  39.45 
 
 		 1316 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0798  proprotein convertase, P  31.58 
 
 		 886 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1449 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.58 
 
 		 831 aa  44.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  30.97 
 
 		 1207 aa  44.3  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  40.54 
 
 		 649 aa  44.3  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>