206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2307 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2307  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
145 aa  287  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  40.29 
 
 
589 aa  83.6  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.61 
 
 
2346 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  35.25 
 
 
614 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  36.92 
 
 
565 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  38.81 
 
 
546 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  40 
 
 
1029 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40 
 
 
1029 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  40.54 
 
 
917 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  33.83 
 
 
1072 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  56.14 
 
 
3209 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.5 
 
 
1180 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  34.21 
 
 
1037 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  35.07 
 
 
547 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  34.88 
 
 
1112 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  30.46 
 
 
1175 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  34.04 
 
 
652 aa  60.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  33.33 
 
 
709 aa  60.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  34.58 
 
 
1346 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.08 
 
 
547 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  32.8 
 
 
448 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3886  hemolysin-type calcium-binding region  32.76 
 
 
540 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.559219  normal  0.150584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  34.11 
 
 
462 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  32.46 
 
 
540 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  35.82 
 
 
574 aa  57  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.89 
 
 
588 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  46.75 
 
 
982 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  32.12 
 
 
681 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  34.21 
 
 
813 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.19 
 
 
1372 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  31.9 
 
 
531 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.73 
 
 
3427 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  54.17 
 
 
2812 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  38.3 
 
 
621 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  42.11 
 
 
417 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  34.11 
 
 
448 aa  53.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  31.2 
 
 
503 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  30.92 
 
 
1019 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  30.63 
 
 
1055 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  30.88 
 
 
2567 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.59 
 
 
1415 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  32.76 
 
 
531 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  35.54 
 
 
7679 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  35.54 
 
 
7919 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  35.34 
 
 
357 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  31.34 
 
 
395 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  45.33 
 
 
329 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  45.33 
 
 
329 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.94 
 
 
6683 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  48.94 
 
 
6779 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  55.32 
 
 
4285 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  32.17 
 
 
395 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  48.94 
 
 
6662 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.94 
 
 
2239 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  31.2 
 
 
503 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2816  hemolysin-type calcium-binding region  36.84 
 
 
351 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  37.96 
 
 
1839 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  38.75 
 
 
5218 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  54.55 
 
 
9030 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  57.14 
 
 
817 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  54.55 
 
 
8682 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  48.98 
 
 
677 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  30.4 
 
 
462 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  54 
 
 
535 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  55.1 
 
 
786 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  37.37 
 
 
1202 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  26.92 
 
 
1022 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  26.92 
 
 
1017 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  63.64 
 
 
202 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  51.72 
 
 
1424 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  43.06 
 
 
1403 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  63.64 
 
 
202 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  47.27 
 
 
1133 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1128  hypothetical protein  34.78 
 
 
362 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  35.76 
 
 
327 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.7 
 
 
5962 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  41.89 
 
 
4848 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  35.05 
 
 
5123 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  51.11 
 
 
1434 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  54.35 
 
 
6753 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  46 
 
 
537 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  60.87 
 
 
260 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  54.17 
 
 
475 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.67 
 
 
2678 aa  47.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  51.02 
 
 
1883 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  57.14 
 
 
2251 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  52.83 
 
 
535 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  49.06 
 
 
2542 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  50 
 
 
3314 aa  47.8  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  37.36 
 
 
393 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  47.73 
 
 
2042 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  42.67 
 
 
313 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.67 
 
 
1073 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  36.94 
 
 
998 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  44.23 
 
 
5171 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  43.66 
 
 
474 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  50 
 
 
1394 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  48 
 
 
486 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  46.55 
 
 
1079 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4608  Hemolysin-type calcium-binding region  37.93 
 
 
491 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.912572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>