139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2834 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  100 
 
 		 1238 aa  2530    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  30.38 
 
 		 1067 aa  349  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2130  hypothetical protein  31.71 
 
 		 758 aa  330  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.251457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3302  glycoside hydrolase family 81  31.52 
 
 		 931 aa  320  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7891  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  31.96 
 
 		 971 aa  315  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  31.4 
 
 		 1139 aa  314  6.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1332  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  30.61 
 
 		 1010 aa  301  6e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137473  hitchhiker  0.00217358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  33.65 
 
 		 773 aa  299  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1836  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  28.47 
 
 		 699 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000209584  normal  0.179835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.28 
 
 		 1139 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3152  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  28.01 
 
 		 704 aa  138  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.486668  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0396  glycoside hydrolase family 81  31.38 
 
 		 638 aa  136  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.803037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0232  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  29.87 
 
 		 729 aa  96.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00472  putative endo beta 1,3 glucanase, GH81 family (Eurofung)  27.62 
 
 		 907 aa  96.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42567  beta-glucan elicitor receptor  33.33 
 
 		 1208 aa  94.4  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.453891  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  31.4 
 
 		 2170 aa  85.1  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  31.7 
 
 		 1887 aa  84.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 455 aa  83.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64411  endo-1,3-beta-glucanase Daughter Specific Expression 4  34.3 
 
 		 969 aa  82.8  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.644497 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60116  endo-1,3-beta- glucanase  24.48 
 
 		 755 aa  82  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  32.68 
 
 		 1221 aa  81.6  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  41.94 
 
 		 731 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  31.98 
 
 		 456 aa  81.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  32.49 
 
 		 456 aa  80.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  31.94 
 
 		 455 aa  80.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  31.94 
 
 		 455 aa  80.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  33.88 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  33.88 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  33.88 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  30.33 
 
 		 1004 aa  78.6  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  32.79 
 
 		 455 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42898  endo-1,3-beta-glucanase  33.49 
 
 		 1058 aa  77.8  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127603  normal  0.94847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  32.29 
 
 		 455 aa  78.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  32.04 
 
 		 455 aa  77.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  39.32 
 
 		 3544 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  32.24 
 
 		 455 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  44.44 
 
 		 2522 aa  75.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  31.03 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  31.52 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  31.4 
 
 		 768 aa  73.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  33.8 
 
 		 854 aa  71.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  43.33 
 
 		 3699 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.33 
 
 		 3699 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  43.33 
 
 		 2503 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  31.19 
 
 		 459 aa  70.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  43.33 
 
 		 2476 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  33.83 
 
 		 2286 aa  69.3  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  35.56 
 
 		 743 aa  69.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  48 
 
 		 405 aa  68.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  28.86 
 
 		 458 aa  67.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  26.79 
 
 		 1154 aa  67.4  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.38 
 
 		 998 aa  66.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  30.92 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.33 
 
 		 729 aa  65.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  42.68 
 
 		 3089 aa  64.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  38.19 
 
 		 614 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  37.76 
 
 		 548 aa  63.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  28.12 
 
 		 680 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  37.76 
 
 		 2839 aa  63.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.16 
 
 		 809 aa  62.4  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  29.35 
 
 		 464 aa  62  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  30.83 
 
 		 3474 aa  61.6  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32797  predicted protein  45.76 
 
 		 1479 aa  61.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.480119  normal  0.167383 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.31 
 
 		 11716 aa  60.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  31.46 
 
 		 1050 aa  60.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  35.67 
 
 		 997 aa  59.3  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  26.77 
 
 		 787 aa  59.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  32.76 
 
 		 1779 aa  58.9  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.42 
 
 		 6885 aa  58.5  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46976  endo-1,3-beta-glucosidase  29.82 
 
 		 918 aa  58.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  32.82 
 
 		 2636 aa  58.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  37.04 
 
 		 544 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  39.81 
 
 		 681 aa  56.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  38.1 
 
 		 831 aa  55.5  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  40.21 
 
 		 548 aa  54.3  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  33 
 
 		 984 aa  54.3  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  27.96 
 
 		 973 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  36.46 
 
 		 617 aa  53.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 823 aa  53.5  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000481721  n/a   
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0017  fibronectin type III domain protein  27.22 
 
 		 481 aa  54.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  35.79 
 
 		 674 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  26 
 
 		 3278 aa  53.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  28.81 
 
 		 2233 aa  52.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3674  Fibronectin type III domain protein  28.17 
 
 		 484 aa  53.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457522  hitchhiker  0.000917339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  24.91 
 
 		 696 aa  51.6  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  33.02 
 
 		 674 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  32.65 
 
 		 1055 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  33.7 
 
 		 674 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  35.96 
 
 		 655 aa  51.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  40 
 
 		 660 aa  50.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  33.7 
 
 		 674 aa  50.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.39 
 
 		 639 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  32.93 
 
 		 1017 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  37.25 
 
 		 749 aa  50.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  29.71 
 
 		 938 aa  49.7  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  32.67 
 
 		 503 aa  50.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  35.48 
 
 		 978 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  39.29 
 
 		 1121 aa  49.3  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  35.79 
 
 		 727 aa  49.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  33.02 
 
 		 674 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>