47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6298 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6298  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  949    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  26.53 
 
 		 841 aa  86.7  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  27.94 
 
 		 712 aa  86.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.34 
 
 		 892 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  25.07 
 
 		 1132 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  24.44 
 
 		 1081 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.28 
 
 		 367 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  25.14 
 
 		 1657 aa  74.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.32 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.3 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  27.91 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  25.61 
 
 		 999 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  25.61 
 
 		 999 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  25.73 
 
 		 999 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  32 
 
 		 1029 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.08 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.38 
 
 		 570 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  28.23 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  27 
 
 		 585 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  24.37 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.42 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.49 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.26 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  27.88 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.67 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.17 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  29.48 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.96 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.39 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  29.64 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  26.39 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  25.91 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  26.03 
 
 		 941 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  26.84 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  26.67 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  24.75 
 
 		 918 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.26 
 
 		 387 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  25.77 
 
 		 475 aa  53.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  23.71 
 
 		 2172 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  28.19 
 
 		 909 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  27.21 
 
 		 908 aa  50.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.53 
 
 		 1505 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  23.67 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  27.8 
 
 		 1182 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  27.98 
 
 		 369 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  27.93 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  24.92 
 
 		 1138 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>